Das Alcianblau/PAS-Färbeset wird zum Nachweis sowohl neutraler, als auch saurer Mukosubstanz eingesetzt. Es kann allein zur Blaufärbung von sauren Muzinen und anderen carboxylierten bzw. sulfathaltigen sauren Mukosubstanzen auf Gewebeschnitten verwendet werden. Das Perjodsäure-Schiff (PAS) Reagenz färbt Glykogen, Basalmembranen und neutrale Mukosubstanzen rosa.